Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms