Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRT87PA6NCN2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms