Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISPDA4D126 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms