Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIPSLA2A3N6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIPSLA2A3N6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms