Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HECTD4Q9Y4D8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms