Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms