Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP8A1Q9Y2Q0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms