Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms