Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FARSAQ9Y285 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms