Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms