Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11AQ9UQ88 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11AQ9UQ88 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11AQ9UQ88 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11AQ9UQ88 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11AQ9UQ88 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11AQ9UQ88 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11AQ9UQ88 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11AQ9UQ88 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms