Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD1BQ9UPS6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD1BQ9UPS6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms