Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZMYND8Q9ULU4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZMYND8Q9ULU4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms