Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PADI1Q9ULC6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms