Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms