Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN11AQ9UI33 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms