Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms