Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NKX1-2Q9UD57 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms