Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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