Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms