Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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