Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms