Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNK4Q9NYG8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms