Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms