Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms