Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms