Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms