Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms