Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FANCFQ9NPI8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FANCFQ9NPI8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FANCFQ9NPI8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FANCFQ9NPI8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FANCFQ9NPI8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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FANCFQ9NPI8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FANCFQ9NPI8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FANCFQ9NPI8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FANCFQ9NPI8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FANCFQ9NPI8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FANCFQ9NPI8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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