Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP29Q9HBJ7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms