Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZMAT3Q9HA38 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZMAT3Q9HA38 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms