Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms