Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms