Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIFKQ9BYG3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIFKQ9BYG3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms