Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRIP1Q9BX63 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms