Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms