Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2AFJQ9BTM1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms