Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD2Q9BTF0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms