Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKP4Q99569 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms