Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms