Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLIN4Q96Q06 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLIN4Q96Q06 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms