Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC7Q96M83 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms