Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms