Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf72Q96LT7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms