Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms