Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF501Q96CX3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms