Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms