Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms