Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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