Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNNM3Q8NE01 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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